三十世纪初，随着人们科技的成熟，星际大航海时代终于开启了。人们在无尽的星空中探索，不断的发现一种又一种新奇的元素跟物质。知识量的增加使科技更加蓬勃的发展，终于在三十末，人们的最强单体作战武器高达“初代机”横空出世。
四十世纪末，已知星系的资源已经无法满足人们的需求。在一艘名为“征服者”的探测飞船不断探索下，人们发现了其他的文明痕迹。
文明之间的碰撞毫无预兆的爆发，人类文明却出乎意料的一触即溃。大量的殖民星系被摧毁，成亿兆的高达战机被摧毁成宇宙垃圾。在付出惨痛的代价后，人们也得到了他们的战利品“能量化个体”。
战败的人类残余利用新的科技建立了大量的孵化基地，开始培养新生代的力量，以期能够夺回疆土。